GMER to program, który wykrywa rootkity. Aplikacja wyszukuje: ukryte procesy, wątki, usługi, pliki, strumienie NTFS, klucze rejestru, moduły przechwytujące wywołania systemowe, przechwytujące przerwania, kontrolujące działanie urządzeń. Program posiada również funkcję monitorinu: uruchamianych procesów, ładowanych sterowników, ładowanych bibliotek, plików, bazy rejestrów, połączeń TCP/IP.